Форум Аборигенной Афганской Борзой

Афганская борзая,
породы и геномика Х группы FCI
L. Epifano 1,2, S.P. Marelli 2 , M.G. Strillacci 2
1 Ambulatorio Beccaglia, Via Alessandro Volta, 2, 20851 Lissone MB
2 Dipartimento di Medicina Veterinaria, Università degli studi di Milano, via dell’Università 6, 26900 Lodi LO1
Перевод Stefano Crippa
Фотографии Hamza Habib
Собаки принадлежат Хамза Хабиб
Каждая официально признанная порода собак является историко-культурным проявлением определенного географического и мировоззренческого контекста. В настоящее время, благодаря биотехнологиям, можно изучать уникальность каждой породы и взаимосвязи между различными породами и популяциями с генетической точки зрения (Parker et al., 2017a). Фрагментарные и не всегда хорошо сохранившиеся археологические останки не всегда позволяют выявлять те черты, которые отличают домашнюю собаку её предка - дикой собаки (Ларсон и др., 2012).

Во многих культурах принято хоронить домашних собак рядом с человеческими захоронениями. Этот обычай привел к обнаружению множества останков домашних собак, которым примерно около 12000 лет, в нескольких регионах Европы, Восточных странах, Ираке, Китае (Morey, 2006). Наличие разнообразных находок в разных географических районах позволяет предположить, что процесс одомашнивания собаки начался независимо в различных популяциях, расположенных в Северном полушарии. Лишь затем собака появилась в Южном полушарии. Например, первые свидетельства о домашних собаках в Южной Америке были найдена только с 5200 г. до н. э., в то время как в Африке к югу от Сахары собака появилась только в 4200 г. до н. э. (Larson et al., 2012). Большое разнообразие требований к домашней собаке, повлияло на фенотипы, которые мы наблюдаем сегодня у разных “современных " пород (Parker et абзац., 2017б). В разнообразии пород можно отметить, что некоторые общие черты собак были закреплены, а благодаря исследованиям, основанным на молекулярной генетике, было отмечено также, что собаки, принадлежащие к одной и той же породе, имели общие фрагменты ДНК при высоком уровне гомозиготности (Irion et al., 2003). В более поздних исследованиях было замечено, что эти общие черты, наблюдаемые среди одной породы, были общими и для других пород, относящихся к одной группе (Vonholdt и др., 2010).

Афганская борзая - охотничья собака “по-зрячему " которая была выбрана в Афганистане кочевыми племенами, проживающими на этой территории. Очень разные и чрезвычайно переменчивые климатические условия этой местности привели к селекции двух разных видов борзых в зависимости от места происхождения. На севере собаки имели более густую шерсть, более компактное тело и темный окрас, в то время как в засушливых районах плоскогорья они были более легкого телосложения, с менее густой шерстью и светлым окрасом (Bell et al., 2012).

Важная работа по обработке геномных данных, выполненная для подготовки диссертации включала в себя анализ генотипов 127 собак, принадлежащих к 11 породам борзых: Афганская борзая, Азавак, Тайган, Шотландский Дирхаунд, Грейхаунд, Ирландский Волкодав, Ливретка (малая Итальянская Борзая), Салюки, Слюги, Сигоу, Уиппет.
Размер выборки для Афганской борзой составил 10 особей. Геномный подход позволил оценить 170000 точек вариации (SNPs; illumineCanina HD BeadChip array) , таким образом, удалось получить большое количество информации, направленное на определение различных породы борзых и определить их генетическое родство. Анализ был проведен с использованием определенного программного обеспечения и полученные результаты позволили определить геномный профиль каждой породы, структуру популяций и взаимоотношения между разными породами X группы.

Анализ основных компонентов (PCA) позволил определить отношения между отдельными группами собак, включенных в эту работу. Большинство из них стабильно группировалось с собственной породной принадлежностью, а малая итальянская борзая и грейхаунд представлялись разбитыми на две субпопуляции.

Если мы рассмотрим ось X на Рис. 1, которая представляет переменную с большей дискриминантной емкостью (PC_1) и проведем воображаемую биссектрису, которая начинается со значения 0.00, мы можем различить два кластера (группы) пород: первая, левая, включает в себя породы, относящиеся к группе “Восточных Борзых”: Афганская борзая ( АFGN), Азаваки (AZWK), Салюки (ЗДОРОВЬЕ), Слюги (SLOU), Сигоу (XIGO), Тайган (BORZ), и субпопуляция малой Итальянской Борзой (ITGY), в то время как справа Грейхаунд (GREY), Уиппет (WHIP), Шотландский Дирхаунд (DEER), Ирландский Волкодав (IWOF) и другая субпопуляция Итальянской Борзой (ITGY) (рядом с воображаемой линией, начинающейся ог значения 0.00 оси Y).

Таким образом, Афганская борзая является частью группы восточных пород, как было заявлено в исследовании Parker и colleghi в 2017 году.
Благодаря этому анализу удалось определить возможных основателей пород, которые являются уникальными. Это говорит о том, что некоторые породы представляют собой исходный генофонд, из которых путем множества скрещиваний впоследствии развились породы борзых. В частности было замечено, что среди пород, принадлежащих к группе восточных борзых, Афганская борзая и Тайган имеют общую родовую популяцию. Таким образом, отмечается близость Афганской борзой к популяции предков.
Анализ индекса фиксации (FST) позволил наблюдать степень генетической дифференциации породы. Эту степень можно классифицировать по: общая дифференциация (FST=1), высокая дифференциация (FST>0,5), средняя дифференциация (0,25<FST<0,5), низкая дифференциация (FST<0,25), без дифференциации (FST =0).
По этой классификации самые высокие значения дифференциации проявляются в отношении Афганской Борзой.

Эта исследовательская работа позволила нам определить положение каждой породы среди борзых пород. Она также помогла понять взаимосвязи между другими породами, и прежде всего теми, которые способствовали развитию других пород от популяции X группы FCI. Афганская Борзая постоянно с момента своего возникновения сохраняла свою уникальность и независимость от соседних восточных пород, что подтверждает её удаленное происхождение. Трудно определить, что привело к этой четкой характеристике. Конечно, мы несомненно определили коэволюцию афганской борзой с населением проживающем в географическом районе происхождения. Эта область, что весьма вероятно, определяется не точными географическими и политическими границами, а путем адаптации к условиям жизни, определенным природным и человеческим отбором в культурном и природно-географическом контексте, уникальным в Мире.